近期COVID-19疫情再度升溫，本市上週(6/16-6/22) COVID-19本土確定病例(併發症)增加77例，比前一週(64例)上升20%，疾病管制署也不斷示警，國內新冠疫情上升且處流行期，預期近期仍呈上升趨勢，評估7月中旬後可能進入高原期。同時，國內外檢出之變異株均以JN.1為主，而近期KP.2及KP.3變異株的占比也略升， JN.1、KP.2及KP.3因具免疫逃脫特性，具較佳傳播力，惟目前研究顯示尚未增加疾病嚴重度，呼籲民眾仍應落實口罩配戴、呼吸道禮節與勤洗手措施。
臺南市政府衛生局局長李翠鳳表示，隨著口罩令解禁，暑假也即將開始，國內外人潮移動頻繁，恐加速病毒傳播速度，提醒市民朋友有疑似或感染呼吸道症狀時，應配戴口罩，以防止呼吸道分泌物散播；此外，曾於一週內與感染呼吸道傳染病患者(COVID-19、流感確診者)有密切接觸，或本身為免疫力低下或高風險者，請避免進入醫療、長照機構，若有需要，應配戴口罩，保護他人、自己免於感染；若是2歲以下嬰幼兒或因身體、心理等因素未能佩戴口罩者，應於咳嗽和打噴嚏時使用衛生紙遮掩口鼻，使用完畢後將衛生紙丟進垃圾桶，並落實洗手步驟執行手部衛生。
另外也在此呼籲市民朋友，COVID-19無症狀、輕症之成人確診者，建議於一般基層診所就醫、居家照護即可；若是出現呼吸困難、持續胸痛或胸悶、意識不清或無法進食等症狀，請立即至醫院就醫；倘若本身為COVID-19併發症之高風險對象(65歲以上長者、孕產婦、患有慢性病或影響免疫功能疾病之民眾)，其快篩陽性後請儘速就醫，以利及早診治並開立口服抗病毒藥物，本市COVID-19抗病毒藥物配置存放院所請點連結(網址：https://gov.tw/ETj )。
5月19日口罩規定雖鬆綁，但在生活回歸常態的同時仍應持續落實肥皂洗手、咳嗽禮節等個人衛生好習慣；並籲請落實就醫分流，依據症狀、個人疾病史及健康狀況至診所或醫院就醫，以避免造成急診壅塞及引發院內傳播，進而影響醫療院所服務量能和效率。