受鋒面影響，各地降下豐沛雨量，造成多處地區積水，連帶著雨後出現大量積水容器，導致病媒蚊孳生機會大增。依據衛福部疾病管制署資料統計截至113年6月5日止，國內今年已有97例境外移入病例，分別自印尼、馬來西亞、馬爾地夫、泰國、新加坡、越南、菲律賓、阿拉伯聯合酋長國、柬埔寨及巴西移入，且高於同期的42例，鄰近之東南亞/南亞登革熱疫情以印尼最高，累計至4月30日共88,593例（621例死亡）。
目前正值登革熱流行期，氣候炎熱加上連續降雨，有利於病媒蚊孳生；本市持續針對高風險場域、寺廟、市場、農果園、工地及人口密集社區進行登革熱病媒蚊孳生源查核，5月份截至5月30日止，共查獲125個積水容器，其中23個容器已孳生病媒蚊幼蟲，同時捕獲9隻埃及斑蚊雌蚊，現場立即清除防治並開單告發。登防中心尤天厚主任呼籲對付登革熱病媒蚊嘸撇步，就是「清除再清除、檢查再檢查」及「巡、倒、清、刷」落實整理家園最好。尤其是下雨過後，儘速檢查清除住家內/外周圍環境積水容器或積水處，才能有效避免病媒蚊孳生。自4月1日起，登革熱防治中心依據傳染病防治法已告發孶生病媒蚊283件，防治登革熱是全民之責，徹底清除孳生源乃是防治登革熱最有效的方法，本市會持續加強社區動員孳清，與社區民眾衛教溝通，貫徹公權力執行，也籲請民眾應配合臺南市政府公告，主動清除孳生源，以免遭罰。
登革熱防治中心提醒市民，如有發燒、頭痛、後眼窩痛、噁心、肌肉及關節痛、出疹等登革熱疑似症狀者，請儘速就醫，主動告知旅遊活動史，使用NS1快篩試劑進行篩檢，有助於縮短病例隱藏期，即早發現即早治療，防範社區登革熱疫情蔓延；本市登革熱NS1快篩試劑醫療院所篩檢站共計403家，篩檢院所資訊請詳見登革熱防治中心網頁（https://health.tainan.gov.tw/dengue/）。登革熱目前並無特殊疫苗，防範境外移入以及社區清除孳生源為不二法門。民眾出遊，應作好相關防蚊措施，包括著長袖淡色衣褲、塗抹防蚊液，平時則應落實孳生源清除工作，避免蚊蟲孳生。